中心实行理事会和主任负责制相结合的组织结构。理事会由主席和委员共同组成。在日常工作方面实行主任负责制， 中心主任及行政机构的基本职责：一是负责筹划、实施中心的长远发展目标；二是为中心的各项研究工作提供服务、 支持和日常管理。

第二理事会

·主 席：沈明明 
·理 事：丁石孙、王学珍、王缉思、王浦劬、王世明、乐黛云、刘宇辉、李章泽、沈仁道、 闵维方、 张康琴、 吴同瑞、吴志攀、沈明明、杨明、郝平、袁明、彭近新、阚延河

行政机构

·中心主任：严洁

中心日常行政实行主任负责制，中心主任及行政机构的基本职责一是为中心的各项研究工作提供服务、支持和日常管理，二是负责筹划、实施中心的长远发展目标。此外，在主任、副主任之下，中心还设有项目主任，负责具体实施中心的研究和调查计划；中心也聘请了一批国内外知名的学者兼职研究人员或者学术顾问，这些学者构成了中心基本的研究队伍。